Harcama Yönetim Sistemi (HYS), Üniversitemiz bütçesinin ve bu kapsamda satın alma işlemlerinin yönetildiği ve izlendiği web tabanlı uygulamadır. Hazine ve Maliye Bakanlığı'nın sağladığı Mali Yönetim Sistemi ile uyumlu olup kurum içi harcama işlemlerinin Rektörlük denetiminde gerçekleştirilmesi için geliştirilmiştir. Bu bağlamda, modülde tüm işlemler yetki temellidir ve gerekli işlemler Rektörlük onayı gerektirir. Kurum bütçesinin yönetimine Strateji Geliştirme Daire Başkanlığı, kurum bütçesi kullanarak satın almaya ise harcama birimleri yetkilidir. Modül; ödenek işlemleri, KİK işlemleri, doğrudan temin kontrolleri gibi özelliklere sahip olmasının yanında hem birim hem de kurum özelinde rapor alma ve harcama ile ilgili duyuru yayınlama gibi imkanlar da sunmaktadır. Ayrıca Strateji Geliştirme Daire Başkanlığı ve Döner Sermaye İşletme Müdürlüğü bütçelerinden kalan, harcanan, eklenen ve toplam bütçelerin raporlarını da listelemektedir.